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CrystalMaker 是可视化晶体和分子结构的最有效方法。它的交互式设计让您“看清树木的森林”,并建立自己对复杂材料的视觉理解。CrystalMaker 超越了传统的晶体学软件,让您可以创建具有可旋转动画的动态可视化。能量建模工具让您可以设计和放松新结构,预测其振动特性,并探索它们如何与其他材料相互作用。
完整的水晶能量建模
CrystalMaker 11 是一个为期 10 年的研究项目的成果,在此期间,我们赞助了一个博士项目和一个知识转移伙伴关系 (KTP)。该项目旨在为个人电脑开发可访问的能量建模和晶格动力学工具。这建立在我们的长期目标之上,即提供对复杂结构和属性的最佳视觉理解,将工作站级工具带入更广泛的科学计算机 – 而无需耗能的超级计算机。
CrystalMaker 11 拥有自己的集成晶体能量建模引擎。其核心是一个巨大的参数化势能库。该程序使用智能选择标准,基于现有的键合标准和对原子环境的详细了解。能量最小化使用一种新颖的混合蒙特卡罗和最小二乘技术,允许实时松弛 – 包括表面。
声子探测器
CrystalMaker 11 可以计算晶体的振动模式,包括色散曲线和结构动画。晶格波或“声子”可以在倒易空间中的任何点上可视化。您可以指定倒易空间中的两个点并显示相应的色散曲线;只需单击色散曲线上的某个点即可定义波矢量并可视化其振动模式。
模拟温度和压力
模拟温度和压力命令可让您模拟温度和(可选)压力的影响。CrystalMaker 将使用恒定体积(“NVT”)或恒定压力(“NPT”)以及您指定的温度/压力运行蒙特卡罗模拟。结构(理想情况下为超晶胞)会实时更新,并绘制能量值。
除了提供结构变化的交互式可视化之外,此命令还提供了一种有用的方法来无序化原本理想的材料,例如为后续的建模计算提供“无定形”结构。
物理和热力学性质
作为能量建模的一部分,CrystalMaker 可以计算晶体的状态密度。这可以直观地显示为直方图,显示不同振动频率的相对数量。底层计算还支持对物理和热力学性质的预测:
分子建模和振动模式
CrystalMake 可让您将粗糙的手绘分子结构转变为最低能量的三维结构。实时可视化松弛过程 – 您甚至可以在松弛时旋转模型。
分子晶体工具
我们的口号是“只见树木不见森林”,这在处理复杂分子晶体时尤其适用。通常,需要观察的不仅仅是不对称单元(首先是堆积),而其他程序则难以处理单元晶胞边缘的碎片分子。
CrystalMaker 的专用工具可让您揭示一个晶胞的完整内容,分离单个分子或显示不对称单元。您可以修复“碎片化”的分子,沿着原子的最近邻居“扩大”绘图范围,并理解复杂性视频。
您现在还可以显示分子晶体中任何选定分子的短非键合接触(“紧密接触”)。只需选择感兴趣的分子中的一个原子,然后选择“选择”>“显示紧密接触”命令即可。任何紧密接触都显示为选定分子和相邻分子中原子之间的次级键。
包装探索者
CrystalMaker 11 是设计新晶体结构的终极工具。全新的 Packing Explorer 可让您将分子转化为晶体,完全控制对称性、细胞参数、分子方向和定位 – 并可选择实时显示紧密接触。
新的工具条提供实时旋转、定位、测量和缩放工具。新的检查器具有动画显示组,可实时更新包装效率和密度。
探测原子环境
CrystalMaker 提供易于使用的屏幕工具,用于测量配位环境 – 键距、角度、扭转角 – 只需单击鼠标或滚动不同的原子和键即可实时输出视频。您还可以可视化配位簇和壳 – 实时调整半径,例如,只需单击鼠标即可构建球形纳米粒子视频。
详细的键距和键角信息可在屏幕上查看,也可以导出到文本文件。强大的距离探测器可让您以图形方式可视化任意元素或位点组合周围的配位环境视频。您还可以可视化 x 射线或中子对分布函数,并可以选择查看选定元素对的“部分”对分布函数视频。
转化与晶体工程
CrystalMaker 可让您变换晶胞、更改晶格类型、构建超晶胞、移动原点或应用任意矩阵变换。您还可以将晶胞投影到所选晶格平面上,以创建“表面晶胞”。与传统软件不同,CrystalMaker 具有优雅、易于使用的界面,并提供常用选项作为预设。轻松进行晶体学研究!
CrystalMaker 的选择工具可让您移动、分离、复制、隐藏和删除原子组。隐藏或修复分子碎片 – 隔离单个分子。以任何方向显示晶格平面;切片晶体以研究表面或内部平面 – 并将一个结构或分子放入另一个结构或分子内。CrystalMaker 的实时晶体工程工具可让您在晶格内插入空间,在晶体中放置新原子或整个分子 – 并设计新的晶格视频。
全面的数据导入和导出
CrystalMaker 可让您导入大约 45 种不同格式的数据:具有即时显示和强大的自定义功能。CrystalMaker 可以处理包括 DL_POLY HISTORY 等多结构文件 – 使用 CrystalMaker 的同步和动画功能快速了解结构行为、晶格动力学或可视化模拟轨迹。CrystalMaker 还可以处理真正大规模的结构。利用我们独特的“深度剖析”工具,快速扫描大规模结构中感兴趣的区域 – 非常适合表征计算机模型的结果。
体积数据可视化
CrystalMaker 可让您将任意数量的 3D 数据集与当前结构相结合,每个数据集都有自己的可视化设置。您可以可视化从文本文件导入的数据,或在电子密度或孔隙度计算视频中在程序内生成的数据。
- 版本
- 大小
- 更新日期
- 兼容系统
- 下载链接
- 11.1.0.300
- 99MB
- 2024-07-20
- Windows10/11
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CrystalMaker 是可视化晶体和分子结构
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